肖尼县（县代码SN）是美国中部堪萨斯州东北部的一个县。截至2010年的人口普查，人口为177,934人，是堪萨斯州人口第三多的县。
其人口最多的城市托皮卡是州府和县城。该县是1855年第一届领土立法机构创建的最初33个县之一。
它是以美国原住民肖尼部落命名的。
1855年8月25日，肖尼县成立。
