巴顿氏菌是一个细菌属。它是Bartonellaceae家族中唯一的一个。该菌种可以寄生并引起动物和人类的疾病。它们主要生活在宿主的细胞中，作为细胞内的寄生虫。
巴顿氏菌是病原体。巴顿氏菌通过媒介，如蜱虫、跳蚤、沙蝇和蚊子传播。已知至少有八个巴顿氏菌种或亚种可以感染人类。
巴顿菌是以医学微生物学家阿尔贝托-莱昂纳多-巴顿（1870-1950）的名字命名的。
