事故当天下午,JA8119已经完成了两个往返航班,分别是往返札幌的JL503/504和往返福冈的JL363/366。下午5点17分,飞机刚刚完成JL366航班,停在东京国际机场的18号点,准备飞往大阪的JL123航班。
下午6点04分,飞机开始向跑道滑行。晚上6点12分起飞,飞机爬升到24000英尺(约7300米)的巡航高度。在那之前,一切都很正常。
在下午6点24分,突然听到一声巨响,这实际上是由压力舱壁的故障引起的。这引起了爆炸性的减压。空气冲出飞机,炸掉了飞机的尾部。由于控制飞机的四条液压管路都位于尾部,飞机变得无法控制。46秒后,飞行员鸣叫7700(意味着他们处于紧急状态),要求返回东京国际机场。然而,尽管空中交通管制员批准飞机转向东京,但飞机却奇怪地开始向西北方向飞去。下午6点28分,东京空中交通管制员要求飞行员向左转,但收到飞行员的信息,"现在无法控制"。那时,飞机正在以一种被称为phugoid运动的方式运动,爬升直到失去速度并失速,然后机头下降并获得速度,直到飞机能够再次爬升。这种phugoid运动一直重复到飞行结束。
下午6点31分,空中交通管制员问飞机是否可以在名古屋机场降落,该机场距离飞机72英里(约133公里)。然而,飞行员想返回东京。在下午6点35分和6点56分之间,飞行员努力控制没有尾翼的飞机。这失败了,因为飞机不受控制地飞向山区。
下午6点56分,飞机的右翼撞上了一个山脊。飞机随后继续飞行,撞上了第二个山脊,并发生了爆炸。520人死亡,4人幸存。
飞机在舱壁故障后坠毁的时间为32分钟。这起事故是航空史上涉及爆炸性减压的最严重事故。