翼龙目是短尾翼龙的亚目。它们的化石记录开始于侏罗纪中期。它们在白垩纪末期的K/T大灭绝事件中灭绝了。翼龙、翼手龙和夸父龙都属于这个亚目。

2014年,在中国发现了最早的翼龙类动物的遗骸。它被称为Kryptodrakon。它的最小年龄是1.627亿年前(mya)。这比以前已知的任何确认的标本都要大500万年。

最近的工作表明,该群体在白垩纪末期的种类比早期认为的要多。在2010年代早期,发现了几个新的翼龙类群,可以追溯到白垩纪晚期。这些发现包括一些小尺寸的翼龙物种。

在白垩纪末期,白垩纪-苍白纪大灭绝事件,使所有非鸟类和大多数禽类恐龙以及许多其他动物都灭绝了。翼龙似乎也在这次事件中灭绝了。