炭藻科是最接近植物的绿藻类。
它们的确切等级是一些争论的问题。一些植物学家建议扩大现有的植物王国,以包括炭藻类和叶绿体。
其他人则将炭疽科列为炭疽科下的一个类,而叶绿素科仍是一个单独的科。也有其他的可能性。
植物学家的共识是,炭藻类是与陆地植物(胚胎植物)关系最密切的生物。
与有性生殖有关的许多复杂的植物性状是在炭藻类中首先进化的。对cpDNA(叶绿体DNA)的分析表明,植物叶绿体的特征也是在炭藻类中首先进化出来的,然后才由Zygnematales从导致Coleochaetales、Charales和陆地植物的系中分化出来。
一般包括在夏草科内的群体有:


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