苏联在阿富汗的战争最初是阿富汗政府军和阿富汗援助战士之间的战争，他们来自国外的支持者。由于没有适当的装备和训练，阿富汗政府无法抵抗被称为圣战者的反对派，最终寻求苏联的援助。对混入当地居民的圣战者的大规模军事行动，造成了当地基础设施的大规模破坏和死亡，使当地居民站在圣战者一边。这种变化，在当地民众中，造成了对苏联军事存在的支持率下降，造成了全国范围内的抵抗，最终陷入了困境。战争从1979年12月开始，一直持续到1989年2月。约有1.5万名苏军士兵阵亡，约3.5万人受伤。约有200万阿富汗平民被杀。反政府军得到了许多国家的支持，主要是美国和巴基斯坦。
战争开始时，苏联派出第40军在阿富汗作战。他们于1979年12月25日到达阿富汗。战斗持续了大约10年。然后，从1988年5月15日起，苏联军队开始离开阿富汗。这种情况一直持续到1989年2月2日。1989年2月15日，苏联宣布其所有部队已离开阿富汗。
1979年，哈菲祖拉-阿明是阿富汗的统治者。苏联的克格勃间谍告诉苏联人，阿明的统治对中亚地区属于苏联的部分构成威胁。他们还怀疑阿明对苏联不忠诚。他们发现了一些关于阿明试图与巴基斯坦和中国友好的信息。苏联人还怀疑阿明是努尔-穆罕默德-塔拉基总统之死的幕后黑手。最后，苏联人决定除掉阿明。
1979年12月22日，苏联驻阿富汗军队的顾问采取了许多步骤。他们切断了喀布尔的所有电信联系。任何信息都不能进入城内，也不能传出城外。苏联空军的部队也到达了喀布尔。阿明看到了危险，为了更好的安全，他搬到了总统府。这座宫殿被命名为塔杰贝格宫。
1979年12月27日，约700名苏军占领了喀布尔的主要政府和军事建筑。部队身着与阿富汗军队类似的制服。晚上7点，苏军摧毁了喀布尔的通信。这就停止了阿富汗军队之间的所有通讯。晚上7点15分，苏军进入塔杰贝格宫。到12月28日上午，军事行动的第一部分已经结束。阿明和他的两个儿子此时已在战斗中牺牲。苏联宣布阿富汗摆脱阿明总统的统治。他们还说，所有苏联士兵都是为了履行"1978年友好、合作和睦邻条约"中规定的职责。
喀布尔广播电台发布了关于Hafizullah Amin被杀的消息。亲苏联的阿富汗革命中央委员会(ARCC)对这起杀人事件负责。随后，阿富汗革命中央委员会选择巴布拉克-卡尔马勒为阿富汗政府首脑。他要求苏联提供军事援助。
阿富汗政府多次要求苏联出兵。尽管苏联与阿富汗签订了援助条约，但担心陷入越南式的泥潭，苏联拒绝了，而是让阿富汗政府与外国雇佣军达成妥协。阿富汗政府和外国雇佣军之间的局势恶化，苏联最初只用情报和顾问来应对。
苏联士兵在阿富汗做了很多事情。但他们永远无法控制阿富汗的所有地区。驻阿富汗的苏军士兵缺乏在阿富汗崎岖的山地进行游击战的适当军事战术，而且许多苏军都是未经战斗考验的年轻新兵。一些阿富汗团体继续攻击并与苏军作战。
世界上大多数国家的人民都不喜欢苏联在阿富汗的所作所为。他们喜欢阿富汗人民与他们作战的方式。有些反应是非常严重的。美国总统卡特说，苏联的行动是"第二次世界大战以来对和平最严重的威胁"。卡特威胁说，除非苏联在1980年2月前撤军，否则将抵制1980年在俄罗斯举行的奥运会。苏联没有这样做，因此美国抵制了奥运会。
到1980年代中期，阿富汗的许多团体组织起来与苏联军队作战。这些团体得到了美国、联合王国、中国、沙特阿拉伯和巴基斯坦等许多国家的帮助。
巴基斯坦认为，苏联在阿富汗的战争对它也是一种威胁。巴基斯坦还通过其情报机构三军情报局，开始积极支持与苏联军队作战的阿富汗人。
苏联在阿富汗的战争似乎是一场永远不会结束的战争。苏联试图控制这个国家，在世界的眼中显得非常糟糕。苏联内部大多数人都不支持这场战争。随着战争的拖延，越来越多的苏联士兵伤亡，米哈伊尔-戈尔巴乔夫会把苏联在阿富汗的战争称为"流血的伤口"。终于，在10年看不到尽头的情况下，苏联人决定退出阿富汗。
苏联在阿富汗的战争严重影响了共产党的统治。许多人认为，这场战争是反对伊斯兰教的。这在中亚各苏维埃共和国的穆斯林民众中产生了强烈的情绪。苏军的精神或"士气"确实非常低落，因为他们无法控制人民，所到之处只被当作侵略者。安德烈-萨哈罗夫公开表示，苏军在阿富汗的行动是错误的。
从1979年到1989年，有超过1.5万名苏军在阿富汗阵亡。在战争中，苏军还损失了数百架飞机和价值数十亿的其他军事机器。约有200万阿富汗男子、妇女和儿童在战争中丧生。
即使在苏军离开阿富汗后，阿富汗的内战仍在继续。在大约三年的时间里，纳吉布拉的共产党政府无法抵御反对它的圣战者部队。政府内部出现了许多团体，其中一些人支持圣战者部队。1992年3月，阿卜杜勒-拉希德-杜斯塔姆将军和他的乌兹别克民兵停止了对纳吉布拉政府的支持。不久，圣战者部队赢得了喀布尔，开始统治阿富汗大部分地区。
在这场持续了约十年的战争中，阿富汗的经济遭受了严重的打击。1978年至1990年，粮食产量下降到每年3.5%。苏联还试图将商业和工业活动置于国家控制之下。这对经济也产生了不好的影响。随着苏联在许多国家的解体，阿富汗的传统贸易也受到影响。
一开始，许多人和国家都赞扬美国支持打击苏联军队的团体。但在"9-11"事件后，人们开始质疑美国支持和资助这些团体的政策。2001年，美国为了寻找拉登，占领了阿富汗。在本-拉登被杀后，占领又持续了近两年。