蛋白質資料庫

蛋白质数据库（PDB）是一个关于大型生物分子，如蛋白质和核酸的三维（3-D）结构的信息集合。来自世界各地的生物学家和生物化学家送来了数据。大多数数据来自X射线晶体学或核磁共振光谱学。任何人都可以免费在线访问PDB。全球蛋白质数据库（wwPDB）负责管理PDB。

PDB对研究结构生物学和结构基因组学的科学家很有用。许多科学家必须将他们的信息发送到该数据库。主要的科学期刊和一些资助机构，如美国的国家卫生研究院，都有规定告诉科学家要把数据送到PDB。PDB拥有原始或主要数据。数以百计的其他数据库重新使用这些数据。这些二级数据库以不同的方式组织信息。例如，SCOP和CATH都将结构归入由结构类型和关于它们如何通过演化联系的想法组织的组。基因本体论把数据放到基于基因的组中。

相关页面

  • 分子运动数据库
  • 全球蛋白质数据库（wwPDB）--区域主机的母网站（如下）。
    • RCSB蛋白质数据库（美国）
    • PDBe (欧洲)
    • PDBj (日本)
    • BMRB，生物磁共振数据库（美国）。
  • wwPDB文档 - 关于PDB和PDBML文件格式的文档。
  • 观察结构 - RCSB的晶体学介绍
  • PDBsum主页 - 从其他数据库中提取有关PDB结构的数据。
  • 核酸数据库，NDB - 一个专门用于搜索核酸的PDB镜像
  • 由PDB赞助的PDB介绍性教程

问题和答案

问：什么是蛋白质数据库（PDB）？
答：蛋白质数据库（PDB）是一个关于大型生物分子（如蛋白质和核酸）三维（3-D）结构的信息集合。

问：PDB中的数据来自哪里？
答：大多数数据来自于X射线晶体学或核磁共振光谱学。

问：谁为PDB送来了数据？
答：世界各地的生物学家和生物化学家送来的数据。

问：任何人都可以访问PDB吗？
答：是的，任何人都可以免费在线访问PDB。

问：谁在管理PDB？
答：全球蛋白质数据库（wwPDB）负责管理PDB。

问：为什么PDB对科学家有用？
答：PDB对研究结构生物学和结构基因组学的科学家很有用。

问：谁向PDB发送他们的信息？
答：许多科学家必须将他们的信息发送到该数据库。主要科学期刊和一些资助机构，如美国国立卫生研究院，都有规定告诉科学家要把数据发送到PDB。

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