有鱗目

有鳞类是一个单系群，是土拨鼠的姐妹群。有鳞类和tuatara一起是鳄鱼和鸟类的姐妹群，是活着的古龙。

有鳞类动物化石首次出现在侏罗纪早期，但线粒体系统发育表明，它们在二叠纪晚期就已进化。有鳞类动物内部的进化关系还没有完全搞清楚，蛇类与其他类群的关系是最有问题的。

从形态学数据来看，鬣蜥被认为很早就与其他有鳞类动物分化了，但最近从线粒体和核DNA得到的分子系统发育并不支持这种早期分化。由于蛇的分子钟比其他有鳞类动物快，而且早期的蛇和蛇的祖先化石很少，所以很难解决蛇和其他有鳞类动物群之间的关系。

最近的研究表明，毒液的进化起源于有鳞动物系统发育的深处。60%的有鳞类动物是有毒的Toxicofera。

Caenophidia、Anguimorpha和Iguania家族的毒液进化了一次，然后这三个家族分化了。这三个品系都有9种共同的毒素。化石记录显示，Anguimorphs、Iguania和高级蛇类之间的分化可追溯到大约200多年前的上三叠世/下侏罗纪。

蛇毒是由一个编码正常调节或生物活性蛋白的基因的复制演变而来。然后该副本在毒腺中表达。

不同的毒素是由不同的蛋白质招募而来，其功能本身也是多种多样的。

自然选择推动了毒素的多样化，以对抗猎物的防御措施。毒液基因形成了大型的多基因家族，并通过蛋白质的进化而进化。这导致了毒素的多样化，让坐以待毙的捕食者攻击广泛的猎物。

迅速的进化和多样化是猎物/食肉动物进化军备竞赛的结果，双方都在适应对方。

通常，该目被分为三个亚目。

• Lacertilia，蜥蜴。
• Serpentes, 蛇类。
• Amphisbaenia，蠕虫蜥蜴。

其中，蜥蜴类形成了一个旁系群。在较新的分类中，Sauria这一名称被用于一般的爬行动物和鸟类，而有鳞类的划分则有所不同。

• 鬣蜥亚目(鬣蜥和变色龙)
• 硬毛虫亚目
• 吉克塔家族(壁虎)Infraorder Gekkota (the geckos)
• Anguimorpha下界（监视器、吉拉怪兽和慢虫）。
• 蜥蜴下目（臭鼬、鞭尾蜥蜴和普通欧洲蜥蜴）
• 蛇亚目(蛇类)
• 蛇形目（毒蛇、蟒蛇、眼镜蛇等）。
• 盲蛇下目（Scolecophidia）。
• 蚜虫亚目