自然选择

自然选择解释了为什么生物体会随着时间的推移而改变，从而拥有它们的解剖学、功能和行为。它的工作原理是这样的。

1. 所有生物都有这样的生育能力，它们的人口数量可以永远迅速增加。
2. 其实，人口数量并没有增加到这种程度。大多数情况下，数量保持差不多。
3. 粮食和其他资源是有限的。所以，对粮食和资源的竞争。
4. 没有两个人是相同的。因此，他们没有相同的生活和繁殖机会。
5. 这种变异大部分是遗传的。父母通过其基因将这些特征传给子女。
6. 下一代来自于那些生存和繁殖的个体。淘汰的原因是个体与生活环境的相对契合度。经过多代之后，种群中有益的遗传差异多了，有害的遗传差异少了。自然选择其实就是一个淘汰的过程。

现在有不少自然种群自然选择的例子。

抗生素耐药性

自然选择发挥作用的一个众所周知的例子是微生物中抗生素抗性的发展。自1928年亚历山大-弗莱明发现青霉素以来，抗生素一直被用于防治细菌性疾病。细菌的自然种群中，在其大量的个体成员中，由于突变，其遗传物质存在着相当大的差异。当接触到抗生素时，大多数细菌很快就会死亡，但有些细菌的突变使它们对抗生素的敏感性稍差。如果接触抗生素的时间很短，这些个体会在治疗中存活下来。淘汰没有抗药性的个体是自然选择的一个例子。

只要有足够的时间，反复接触抗生素，就会出现抗生素耐药菌群。这就导致了所谓的进化军备竞赛，或者说共同进化，在这种情况下，细菌继续发展对抗生素不那么敏感的菌株，而医学研究人员则继续开发能够杀死它们的新抗生素。应对策略通常包括使用不同的、更强的抗生素；然而，最近出现了新的MRSA菌株，甚至对这些药物也有抗药性。植物和昆虫对杀虫剂的抗药性以及疟疾对奎宁的抗药性也出现了类似的情况。

伪装

一个著名的案例是花椒蛾进化的研究，还有很多其他的例子。这些日飞蛾大多是浅色的，但只有少数蛾子是深色的。起初，浅色的蛾子生存得比较好，因为它们在附近树木的浅色中得到了伪装。这使得鸟类很难看到它们。

当工厂建成后，污染使所有的树木看起来都是黑色的。现在浅色的蛾子在黑树皮的衬托下，显得格外明显。环境改变后，深色的蛾子占了优势。控制深色的基因在蛾子的群体中传播。第二次世界大战后，对污染的控制起到了作用，使环境变得更加清洁。然后，浅色的蛾子又有了优势，现在更常见了。

模仿是另一个例子。一些无害的昆虫会模仿其他危险的昆虫 或味道难闻的昆虫。模仿的进化是因为更好的模仿者能更好地生存。它们比那些不那么好的模仿者活得更久，产生的后代也更多。更好的模仿者的基因在物种中变得更加普遍。随着时间的推移，模仿物种越来越接近它们的模型。

性选择是一种特殊的自然选择。它是查尔斯-达尔文的一种理论，认为某些进化特征可以用物种内部的竞争来解释。达尔文将性选择定义为"一种性别的个体，一般是雄性，为占有另一种性别而进行的斗争"的影响。通常是雄性之间相互争斗。由雄性战斗所选择的性状称为第二性征（包括角、鹿角等），有时也称为"武器"。由择偶选择的性状称为'装饰品'。

雌性通常喜欢与具有外部装饰物的雄性交配--夸张的形态特征。能够使雄性发展出令人印象深刻的装饰品或战斗能力的基因，可能只是展示了更强的抗病能力或更高效的新陈代谢--这些特征也有利于雌性。这种想法被称为"好基因"假说。性选择至今仍在研究和讨论中。

Ernst Mayr说。

"自达尔文时代以来，人们已经清楚地认识到，这种选择包括更广泛的现象，与其说是有性选择，不如说是生殖成功的选择.与生存选择不同，它涉及的是真正的选择，而不是淘汰。考虑到年复一年地发现了许多新的生殖成功选择，我开始怀疑它是否比生存选择更重要，至少在某些高等生物中是如此"。