分子伴侣是帮助大分子折叠或展开的蛋白质。有些帮助组装或拆开其他大分子结构。当这些结构发挥其正常功能时，它们不会出现在这些结构中。

第一个被称为伴侣的蛋白质协助从折叠的组蛋白和DNA组装核糖体。那些组装伴侣，特别是在细胞核中，将折叠的亚单位组装成较大的结构，如细胞器。

伴侣的一个主要功能是防止多肽链和组装的亚单位粘在一起，形成不能发挥作用的团块。一些伴侣是 "保持酶"，其作用是阻止聚集。另一些则被称为 "折叠酶"，确实有助于折叠那些自己无法做到的蛋白质。这种蛋白质违反了安芬森的教条。