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当果蝠从一棵植物飞到另一棵植物上获取食物时，它们也为它们所访问的植物授粉。此外，它们在进食时还会散播植物的种子。许多植物，包括一些鳄梨、椰枣、芒果和桃子，都依赖这些蝙蝠授粉或散播种子。

果蝠主要吃水果汁和花蜜。它们咀嚼水果，然后吐出种子、果皮和果肉。果蝠，像其他Megachiropteran蝙蝠一样，使用嗅觉来寻找它们的食物，水果和/或花蜜。虽然它们的眼睛很大，可以看得很清楚，但果蝠并不把视觉作为它们的主要感官。果蝠也吃其他东西。

一些巨兽是危险疾病的载体。人类首次爆发埃博拉病毒的记录是在1976年，但病毒的来源仍然不明。最近的测试表明，在埃博拉病毒爆发期间收集到的一些种类的果蝠显示蝙蝠有这种病毒，但没有任何迹象。进一步的研究还表明，埃博拉病毒可以在果蝠和 "Tadarida "属的其他蝙蝠中繁殖。这可能意味着这些蝙蝠是病毒的来源。与埃博拉病毒有关的马尔堡病毒也已在乌干达的果蝠身上被发现。

另一种解释是，果蝠可能是一种中间宿主，因为不确定果蝠是埃博拉病毒的索引案例。同样重要的是要注意，非洲的某些种类的果蝠对埃博拉病毒有免疫力，它们的DNA或RNA与扎伊尔埃博拉病毒相似。这可以解释向人类的传播，因为该地区的人们倾向于吃果蝠。

众所周知，澳大利亚的飞狐携带两种可能对人类健康构成严重威胁的传染病--澳大利亚蝙蝠利萨病毒和亨德拉病毒（Henipavirus）。这些由蝙蝠传播的疾病是昆士兰特有的，是西方世界中最致命的病毒之一。虽然罕见，但这些疾病仍然让医学专家感到神秘。这些蝙蝠传播的疾病几乎总是致命的。幸运的是，人类感染这些病毒的情况非常罕见。

亨德拉病毒是一种主要感染巨型蝙蝠（大型果蝠，或称 "飞狐"）的病毒，可以传给马。与埃博拉和马尔堡一样，亨德拉是一种出血性热病，死亡率很高甚至非常高（50-90%）。埃博拉和马尔堡病毒都与作为传染媒介的巨兽有关。人们认为，马匹通过摄入被受感染的巨豚体液和排泄物污染的食物或水而感染亨德拉病毒。这种病毒对人类和马匹都是致命的。当没有处理或直接与飞狐身体接触时，公共卫生风险可以忽略不计。

目前已知只有三个人在蝙蝠传播的亨德拉病毒中幸存下来。到目前为止，在所有感染亨德拉病毒的人中，有一半以上在六周内死亡，然而，在昆士兰第二种蝙蝠传播的疾病中没有幸存者。1994年，莱塞病毒--狂犬病病毒的近亲--首次在新南威尔士州巴利纳（位于昆士兰州边界）附近的一只出现症状的飞狐中被发现。荔枝病毒已经杀死了仅有的三个感染者。

• 埃及果蝠