辅因子（或辅助因子）是一种化学化合物，它不是蛋白质，但却附着在蛋白质上。该化合物是蛋白质的生物活性所需要的。在大多数情况下，蛋白质将是一种酶，而辅助因子将帮助该酶工作。如果是这样，辅助因子也被称为辅酶。

作为复杂有机分子的辅助因子通常被称为辅酶。如果通过共价键连接，它们就是一个修复基团。但如果它们只是暂时连接，那么辅助因子就是一个辅基。

有些酶需要几个辅助因子。有机辅助因子通常是维生素，或由维生素制成。金属离子通常是辅助因子，但许多辅助因子都有无机和有机部分。