潘多拉病毒是一个非常大的病毒属。它们的基因组是所有病毒属中最大的。像其他大型病毒Mimivirus、Pithovirus和Megavirus一样,潘多拉病毒感染变形虫。它的基因组有1.9至2.5兆字节的DNA,是梅加病毒的两倍大。它在外观和基因组结构上与其他大型病毒有很大不同。
虽然皮诺病毒的外壳尺寸大50%,但潘多拉病毒的基因组是所有病毒中最大的(250万碱基对)。
大约93%的潘多拉病毒基因在任何其他微生物中都是未知的。这导致一些科学家认为该病毒属于细菌、古细菌和真核生物之外的 "第四域"。病毒作为一个整体不被认为属于这三个领域,但过去一些生物学家曾建议将其作为一个领域。