一个生物体的基因组是其DNA(或某些病毒的RNA)中编码的全部遗传信息。这包括基因和DNA的非编码序列。汉斯-温克勒教授在1920年创造了这个术语。
温克勒的定义,翻译过来就是:
"我提出了单倍体染色体组的表达基因组,它和相关的原生质一起,规定了物种的物质基础 ...." p165
然而,没有一个单倍体染色体组甚至定义了一个物种的DNA。由于一个种群所携带的等位基因种类繁多,每个个体的基因都是不同的。即使是一个二倍体个体也会携带遗传多样性。由于这个原因,多布赞斯基更倾向于"染色体组",现在的定义必须比温克勒斯的定义更广泛。单倍体染色体组的基因组只是一个物种总的遗传变异的样本。
基因组"一词可专门用于指完整的核DNA集合("核基因组"),但也可用于指含有自身DNA的细胞器,如线粒体基因组或叶绿体基因组。