人工选择是指有目的地对植物或动物进行育种。它与选择性育种的含义相同，是一种古老的基因工程方法。

选择性育种是在培育狗、鸽子或牛等家养动物时使用的一种技术。这些动物中的一些特性可能是饲养者希望延续到下一代的，因此饲养者会选择那些具有这种特性的动物进行饲养，而不是选择那些不具有这种特性的动物。因此，育种者会选择那些具有这种品质的动物进行繁殖，而不是选择那些不具有这种品质的动物。

近亲繁殖是一种特殊的选择性育种，其目的是为了培育出基因几乎相同的种群。这种种群在实验室外很少能存活。它们会丧失生育能力。为了控制这种情况，大多数品种都会与野生型个体进行杂交或回交，或者至少是较少的近亲繁殖。细节因品种而异。外交时的改良称为杂交活力。

查尔斯-达尔文以人工选择为例，介绍了他的自然选择思想。人工选择可以与自然选择的过程相对照。在自然选择中，具有某些性状的生物体发生了差异性繁殖。这是因为一些变异有助于生物体有更好的生存和繁殖。这个过程保持或增强了一个种群在其自然生境中的适应性。

人工选择有时可能是无意的，有人认为早期人类对农作物的驯化主要是无意的。