孢子是真菌和一些非种子植物（蕨类和苔藓）的繁殖方式。它们也由细菌制造，用于长期生存。一些原生动物也制造长期生存的孢子。

种子植物的孢子是单细胞，生长为花粉粒或胚珠内的配子体。高等植物的种子的结构比孢子更复杂。种子的主要 "创新 "是为发育中的胚胎提供营养，这是孢子所不具备的。