氨基酸

架构

氨基酸是一种有机化学物。它由一个α-碳原子与四个基团共价结合而成。

• 氢原子
• 氨基
• 羧基
• 变R组

除脯氨酸外，每个氨基酸至少有一个氨基基团（-_NH2）和一个羧基（-COOH）。

基因表达和生物化学

这些是蛋白原氨基酸，是蛋白质的构成部分。它们是由任何生物体的遗传密码中的细胞机械所产生的。

* UAG通常是琥珀色的终止密码子，但如果存在PYLIS元素，则编码吡咯赖氨酸。
** UGA 通常是乳白色（或黄色）的终止密码子，但如果存在 SECIS 元素，则编码硒半胱氨酸。
† 停止密码子不是一个氨基酸，但为了完整起见而包括在内。
††UAG和UGA并不总是作为终止密码子（见上文）。
‡ 必需氨基酸不能在人体内合成。它必须由饮食中提供。饮食中通常不需要条件性必需氨基酸，但必须向缺乏必需氨基酸的人群提供。

在生物合成过程中，这些α-氨基酸进一步出现的非必需品在结构上（这里使用SMILES符号）相关。

OC(=O)C(N)-

• ├ H ... ↪So_1F156↩甘氨酸。
• ├ C ...... ↪So_1F150↩ 丙氨酸。
• │├ C ... 2-氨基丁酸
• ││├C ......诺瓦林
• │││├-2H ... ↪So_1F15F↩脯氨酸（脱氢诺瓦林）。
•  
• ││││└ N ...↪So_1F15A↩赖氨酸。
• ││││ └ C(=O)C1N=CCC1C ......↪So_1F15E↩ Pyrrolysine。
• │││└NC(=N)N ......↪So_1F161↩精氨酸。
• ││├C(=O)N ......↪So_1F160↩谷氨酰胺。
• ││├ C(=O)O ......↪So_1F154↩ 谷氨酸。
•  
• ││└ S ... 同型半胱氨酸。
• ││ └ C ... ↪So_1F15C↩Methionine.
• │├C(C)C ......↪So_1F15B↩亮氨酸。
• │├C(=O)N ......↪So_1F15D↩Asparagine。
• │├ C(=O)O ...↪So_1F153↩天门冬氨酸
• │├C1=CNC=N1 .......↪So_1F157↩组氨酸。
• ├ │ c1ccccc1 ... ↪So_1F155↩苯丙氨酸。
• ├ │ c1ccc(O)cc1 ......↪So_1F168↩酪氨酸。
• ├ │ C1=CNc2ccccc12 ...... ↪So_1F166↩ 色氨酸。
• │├C1=CNc2ccc(O)cc12 ......Oxitriptan。
• ├ │ c(cc1I)cc(I)c1-O-c2cc(I)c(O)c(I)c2 .甲状腺素。
• │├ O ... ↪So_1F162↩SERINE
• │├ S ... ↪So_1F152↩ 半胱氨酸。
• │└[SeH] ......↪So_1F164↩ Selenocysteine。
• ├ C(C)C ...... ↪So_1F165↩ Valine
• ├C(C)O ......↪So_1F163↩苏氨酸。
• └C(C)CC ......↪So_1F158↩Isoleucine。