在过去,基孔肯雅病毒主要存在于发展中国家。然而,最近,在印度洋、太平洋岛屿和美洲出现了流行病(有非常多的人感染该病毒)。
1952年首次发现基孔肯雅病时,它并不常见,只发生在西非。人们通常在雨季感染这种疾病,因为蚊子在这些时候更常见。从20世纪60年代开始,有时在亚洲和非洲爆发。然而,直到2005年,基孔肯雅病在全世界都是不常见的。
自2005年以来,基孔肯雅病毒已变得更加普遍。它已经在非洲、亚洲和美洲引起了大规模的暴发。例如,在印度,基孔肯雅病毒在32年后再次出现,当时没有任何印度人感染过这种病毒。欧洲、加勒比海和南美洲也爆发了基孔肯雅病毒,这些地方以前从未传播过这种病毒。在美国和澳大利亚也有少数人感染了基孔肯雅病毒,而这些地方以前从未出现过这种病毒。
2005年,印度洋上的一个岛屿留尼汪岛爆发了一次非常大的疫情。在居住在该岛的约77万人中,约有26.6万人(每3人中有1人以上)感染了基孔肯雅病毒。2006年,印度大约有125万人感染了这种病毒。
基孔肯雅病毒最近传播到了美洲。从2013-2014年在美洲,1,118,763人被认为患有该病毒。在这些病例中,24,682人被证明是基孔肯雅病毒。
一些科学家认为,基孔肯雅病毒变得更加普遍是因为该病毒的遗传密码发生了变化。这种变化可能使病毒更容易在蚊子细胞中复制自己。它还可能使该病毒更容易被亚洲虎蚊(白纹伊蚊)传播。这很重要,因为亚洲虎蚊比埃及伊蚊生活在更多的地方,埃及伊蚊是向人类传播基孔肯雅病毒的另一种蚊子。埃及伊蚊只生活在热带地区。然而,亚洲虎蚊很容易传播,并生活在欧洲、美洲、加勒比海、非洲和中东地区。