眼睛的某些组成部分，如视觉色素，似乎有一个共同的祖先--也就是说，在动物辐射之前，它们就已经进化了一次。
然而，复杂的、形成图像的眼睛进化了大约50到100次--在其构造中使用了许多相同的蛋白质和遗传工具包。
复杂的眼睛似乎是在几百万年内首次进化的，在被称为寒武纪大爆发的快速进化中。在寒武纪之前没有眼睛的证据，但在中寒武纪伯吉斯页岩中可以看到广泛的多样性。
眼睛显示出广泛的适应性，以满足携带它们的生物体的要求。眼睛的敏锐度、能够探测到的波长范围、在低光下的敏感性、探测运动或分辨物体的能力以及是否能够辨别颜色，都可能有所不同。
最早的光传感器是光感受器蛋白。它们是眼窝，在原生动物中发现。眼点只能区分光和暗。这对于光周期论和昼夜节律的每日同步来说是足够的。它们不能区分形状或确定光的方向。
几乎所有的主要动物群体中都有眼斑。尤金'娜斯的眼点，称为柱头，位于前面。它的红色色素为光敏晶体的集合着色。与领先的鞭毛一起，眼斑使生物体能够对光线做出反应，以协助光合作用，并预测白天和夜晚，这是昼夜节律的主要功能。
视觉色素位于更复杂的生物体的大脑中，并被认为具有使产卵与月球周期同步的作用。通过检测夜间光照的微妙变化，生物体可以同步释放精子和卵子，以最大限度地提高受精概率。
视觉本身依赖于所有眼睛共同的基本生物化学。这个生化工具箱如何被用来解释一个生物体的环境，差别很大。眼睛有各种各样的结构和形式，相对于基本的蛋白质和分子来说，所有这些都是很晚才进化的。
在细胞水平上，似乎有两种主要的眼睛 "设计"，一种是原生动物（软体动物、环虫和节肢动物）拥有的，另一种是脱毛动物（脊索动物和棘皮动物）。
问：同源器官的例子是什么？
答：眼睛的进化是同源器官的一个例子，许多动物都有。
问：眼球蛋白有什么作用？
答：眼球蛋白控制光子转化为电信号的过程。
问：复杂的眼睛是什么时候进化的？
答：复杂的眼睛似乎是在几百万年后，在被称为寒武纪大爆发的快速进化中首次进化的。
问：在寒武纪之前有眼睛的证据吗？
答：在寒武纪之前没有眼睛的证据，但在中寒武纪伯吉斯页岩的化石中可以看到许多眼睛。
问：不同生物的眼睛有什么不同？
答：眼睛在其敏锐度（视力的准确性）、在低光照度下的敏感性以及探测运动或识别物体的能力方面都有不同。它们对波长的敏感性决定了它们是否能看到颜色，以及它们能看到哪些颜色。
问：黑色素起什么作用？
答：黑色素是哺乳动物视网膜中的一种蛋白，它参与昼夜节律和瞳孔反射，但不参与视觉。
问：什么事件标志着复杂的眼睛开始进化？
答：复杂的眼睛是在被称为寒武纪大爆发的快速进化过程中开始进化的。