门德尔松的家庭有很多钱。他们对音乐、文学、绘画等也非常感兴趣。他的祖父摩西-门德尔松在德国民族文学中很有名。他的父亲是一名银行家,他的母亲来自一个在柏林拥有很多工厂的家庭。年轻的费利克斯在家中接受了父母的教育。虽然这个家庭是犹太人,但他的父母让菲利克斯接受了洗礼,几年后他的父亲成为了一名基督徒。门德尔松家族在这个时候将巴托尔迪的名字加入到他们的名字中。
很快,菲利克斯就得到了包括路德维希-伯格在内的私人教师的指导,后者教他钢琴。他还学习了音乐理论和作曲。9岁时,他在一场音乐会上演奏了钢琴,并开始创作带音乐的小剧本(德语称为Singspiel)。1821年,他被带到魏玛去见著名作家歌德。这是几次访问中的第一次,歌德的思维方式和他的德国文学作品对年轻的门德尔松产生了很大影响。他在这个时候创作了几部作品,包括歌唱剧、交响曲和室内乐。他与父亲一起旅行,认识了许多著名的音乐家。
1825年,他们全家搬到了柏林。他们在周日上午在他们的大房子里定期举行音乐会。许多富人和名人被邀请参加他们的私人音乐会。1825年10月,他写了一首弦乐八重奏(为八种弦乐器演奏的乐曲),这是他最好的作品之一。他研究了约翰-塞巴斯蒂安-巴赫(1685-1750)的音乐,人们几乎已经忘记了他的音乐。他找到了巴赫的《圣马太受难曲》的音乐,并在1829年指挥了一场演出。这是音乐史上一次著名的演出,因为人们突然意识到巴赫是多么伟大。从那时起,巴赫的音乐再也没有被遗忘。
在1829年至1835年期间,门德尔松走遍了整个欧洲。他多次访问伦敦,还在那里演奏了贝多芬的皇帝协奏曲。他去了苏格兰,在那里他航行到内赫布里底群岛的芬格尔洞。这激发了他写下了名为《赫布里底群岛》的序曲。当他返回时,马车发生了事故,他的膝盖受伤。他在作曲家托马斯-阿特伍德那里住了一段时间,然后才得以返回柏林。接下来他去了意大利,在那里他写了《意大利交响曲》。在意大利,他遇到了赫克托-柏辽兹,在回来的路上他遇到了肖邦。
他在杜塞尔多夫呆了一段时间,在那里他表演了亨德尔的几部清唱剧以及他自己的音乐。在美因河畔的法兰克福,他住在一个有两个女儿的家庭。他与其中一个女儿塞西尔-夏洛特-索菲亚-让雷诺(Cécile Charlotte Sophia Jeanrenaud)于2008年结婚。 1837.他们的婚姻很幸福,有五个孩子。
菲利克斯和他年轻的妻子来到莱比锡生活,在那里他成为著名的莱比锡格万豪斯乐团的指挥。这是德国最高的音乐工作之一。他指挥了许多被遗忘的18世纪作曲家的音乐。他还首次演奏了舒伯特的C大调交响曲,该曲子在舒伯特去世九年后被罗伯特-舒曼发现。门德尔松让一些最著名的音乐家来到莱比锡,与乐团一起演出。克拉拉-舒曼、弗朗茨-李斯特、安东-鲁宾斯坦、年轻的小提琴家约瑟夫-约阿希姆和瑞典女高音歌唱家珍妮-林德。门德尔松改进了乐团的演奏,使他们成为世界上最好的乐团之一。他还确保演奏家们得到了很好的报酬。
1840年代初,门德尔松在柏林呆了一段时间。新国王,普鲁士国王弗里德里希-威廉四世,非常热衷于音乐,对音乐会的新计划有很多想法。他希望门德尔松能负责此事。国王希望看到希腊戏剧的演出,门德尔松必须为《安提戈涅》的演出编写附带音乐。
1842年6月,门德尔松在伦敦维多利亚女王的宫殿里两次受到她的接待。门德尔松为感谢女王,将他的《苏格兰交响曲》献给了她。他继续在莱比锡担任指挥,并帮助使柏辽兹的音乐在德国出名。他成为莱比锡新音乐学院的院长。在柏林,国王要求他为莎士比亚的戏剧《仲夏夜之梦》提供附带音乐。他在17年前就已经写了一些这样的音乐,但现在他完成了它,并在1843年演出了它。
在他的最后几年里,门德尔松的健康状况很差。他继续工作并尽可能地旅行,但在1849年的一次中风后,他在莱比锡去世,享年38岁。他的遗体被一辆专列运到柏林,在那里他被埋葬在他姐姐范妮的坟墓附近。